Introduction
Les poissons diadromes, en raison de leur cycle de vie complexe, sont d'excellents indicateurs des perturbations locales et globales des écosystèmes. La compréhension de la dynamique de ces populations est un enjeu scientifique et sociétal majeur pour assurer à la fois leur conservation et leur exploitation durable. Les recherches se concentrent sur la réponse des populations de salmonidés aux changements environnementaux, avec une application particulière à la gestion du saumon atlantique et de la truite de mer. Ces études utilisent des archives de suivi à long terme pour réduire l'incertitude des observations empiriques, améliorer la description de l'hétérogénéité interindividuelle et permettre des comparaisons inter-populations.
Approches Populationnelles et Individuelles
La combinaison des approches populationnelles et individuelles est essentielle pour étudier l'impact de l'environnement sur divers aspects de la vie des salmonidés. Cela comprend :
- La taille des salmonidés: Comment les conditions environnementales affectent la croissance des poissons.
- La structure d'âge: L'influence de l'environnement sur la composition par âge des populations.
- La décision de migration: Les facteurs environnementaux qui influencent les choix de migration des poissons.
- La dynamique de la population: L'impact global de l'environnement sur la croissance et la survie des populations.
Automatisation de l'Analyse des Données par Réseaux de Neurones Convolutifs
L'automatisation de l'analyse des données issues des caméras acoustiques est un domaine de recherche prometteur. L'utilisation de réseaux de neurones convolutifs permet d'améliorer l'efficacité et la précision de l'identification et du suivi des poissons dans leur environnement naturel. Cette technologie offre des perspectives intéressantes pour la surveillance des populations de poissons migrateurs et l'évaluation de l'impact des activités humaines sur les écosystèmes aquatiques. Des chercheurs tels que Martignac François, Fernandez-Garcia Guglielmo, Corpetti Thomas, Nevoux Marie, Beaulaton Laurent (2025) travaillent sur cette automatisation.
Synthèses sur l’État des Populations de Poissons Migrateurs Amphihalins
Des synthèses régulières sont nécessaires pour évaluer l'état des populations de poissons migrateurs amphihalins en France. Ces synthèses couvrent plusieurs aspects :
- L'état des populations d'aloses, de lamproies, de saumon et de truite de mer.
- Les pressions exercées sur ces populations, telles que la pollution, la fragmentation des habitats et la surpêche.
- Les modalités de gestion mises en œuvre pour assurer la conservation et l'exploitation durable de ces espèces.
André Guirec, Chapon Pierre-Marie, Charles Maud, Clermont-Ledez Yohann, Diouach Omar, Guillerme Noémie, Josset Quentin, Launey Sophie, Legrand Marion, Nevoux Marie, Sauvadet Coralie, Beaulaton Laurent (2025) contribuent à ces synthèses.
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Reconstruction des Séries Temporelles d'Abondance et de Taux d'Exploitation du Saumon Atlantique
Le projet PastSatAb, mené par Lebot Clément, Rivot Etienne, Beaulaton Laurent, Buoro Mathieu, Nevoux Marie, Prévost Etienne (2025), vise à reconstruire les séries temporelles historiques de l'abondance et des taux d'exploitation du saumon atlantique en France. Cette reconstruction est essentielle pour comprendre les tendances passées, évaluer l'efficacité des mesures de gestion et prévoir l'évolution future des populations. L'Office Français de la Biodiversité (OFB) soutient ce projet.
Amélioration des Connaissances sur les Espèces Diadromes
L'amélioration des connaissances sur les espèces diadromes passe par la mise en place d'un suivi de la pêche récréative et professionnelle du saumon atlantique (Salmo salar), de la truite de mer (Salmo trutta) et de l'anguille (Anguilla anguilla). Boulenger Clarisse, André Guirec, Koubaa Adly, Tréhin Cécile, Launey Sophie, Besnard Anne-Laure, Nevoux Marie, Gauteur Élise, Beaulaton Laurent, Marchand Frédéric (2025) travaillent à cet objectif.
SalmoGlob : Un Modèle pour l'Évaluation des Stocks de Saumon Atlantique à l'Échelle de l'Atlantique Nord
Le développement de modèles d'évaluation des stocks de saumon atlantique à l'échelle de l'Atlantique Nord est crucial pour une gestion coordonnée et efficace de cette espèce migratrice. SalmoGlob, un nouveau modèle développé par Rivot Etienne, Olmos Maxime, Lemaire-Patin Remi, Hernvann Pierre‐yves, Nevoux Marie, Prévost Etienne, Buoro Mathieu, Beaulaton Laurent (2025), vise à répondre à ce besoin.
Rénovation de la Gestion du Saumon en Bretagne : Le Projet RENOSAUM
Le projet RENOSAUM, mené par Prevost Étienne, Lebot Clément, Beaulaton Laurent, Arago Marie-Andrée, Leprévost Gaëlle, Nevoux Marie, Rivot Étienne (2025), vise à rénover la gestion du saumon en Bretagne. Ce projet prend en compte les spécificités locales et les enjeux socio-économiques liés à la pêche du saumon.
État des Populations de Truite de Mer en France
Une synthèse sur l'état des populations, des pressions et des modalités de gestion de la truite de mer en France a été réalisée par André Guirec, Josset Quentin, Launey Sophie, Nevoux Marie, Beaulaton Laurent (2024). Ce rapport final, commandé par l'Office Français de la Biodiversité (OFB), l'INRAE, l'Institut Agro Rennes Angers, l'UPPA et le Pôle Gestion des Migrateurs Amphihalins dans leur Environnement, fournit une base solide pour la prise de décision en matière de gestion de la truite de mer.
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Mobilisation des Données sur le Saumon
La mobilisation des données sur le saumon est essentielle pour faciliter la recherche et la gestion de cette espèce. Diack Graeme, Bird Tom, Akenhead Scott, Bayer Jennifer, Brophy Deirdre, Bull Colin, de Eyto Elvira, Johnson Brett, Jones Matthew, Knight Alexis, Nevoux Marie, van der Stap Tim, Walker Alan (2024) contribuent à cet effort.
Changements dans la Longueur à la Première Remontée de la Truite de Mer
Une étude menée par Josset Quentin, Beaulaton Laurent, Romakkaniemi Atso, Nevoux Marie (2024) a examiné les changements dans la longueur à la première remontée d'une population de truite de mer (Salmo trutta) dans le nord de la France. Cette étude a révélé des variations significatives de la taille des poissons au moment de leur première migration de retour vers les rivières, ce qui peut avoir des implications importantes pour la dynamique de la population.
Déterminisme du Sexe et Température
Le sexe de nombreuses espèces de poissons ou de reptiles est déterminé par la température à laquelle l’organisme est exposé en début de vie. Cela permet une adaptation des populations aux conditions environnementales quand elles donnent un avantage reproductif à l'un ou l'autre sexe. Par exemple, si la fécondité est liée à la taille des femelles, celles-ci seront favorisées par des conditions permettant une forte croissance. Cet effet de la température se produit pendant une période bien déterminée (l'incubation chez les reptiles, et les jeunes stades, après éclosion, chez les poissons).
Dans les populations naturelles de bar, le sex-ratio est en moyenne équilibré (autant de mâles que de femelles), avec cependant des variations liées aux conditions climatiques annuelles. En élevage, on observe souvent une prédominance de mâles (de 75 à 95% de mâles dans la population), alors que les individus femelles sont plus recherchés compte tenu de leur croissance plus rapide et d’une puberté plus tardive. Les éleveurs et les chercheurs se sont donc interrogés sur les origines de ces différences.
Des études antérieures ont pu montrer que le sexe du bar était déterminé à la fois par des facteurs génétiques (pas de chromosomes X ou Y, mais une « tendance sexuelle » mâle ou femelle liée à l’effet combiné de nombreux gènes) et par la température de l’eau pendant les premiers mois de vie. Il subsistait néanmoins une controverse sur cet effet de la température : alors qu’une majorité d’études montraient un effet féminisant des basses températures, quelques autres montraient un effet inverse (effet masculinisant des basses températures).
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Généralement, les températures basses ralentissent la croissance des animaux à sang froid, comme les poissons. Il semblait donc plutôt contre-intuitif que les femelles, qui grandissent plus vite que les mâles, soient favorisées par des températures basses. « C’est cette contradiction qui nous a incités à émettre une hypothèse originale », explique Marc Vandeputte, chercheur au sein de l’unité GABI d’INRAE. « La saison de ponte des bars s'étale de février à fin mars. Nous pouvions donc faire l'hypothèse qu'une ponte en début de saison, dans une eau plutôt froide, permettrait une saison de croissance à venir plus longue, et, en conséquence, une taille plus importante au moment de la reproduction, critère important pour les femelles. Cela pourrait expliquer que l'eau froide favorise le développement de femelles.
Pour tester cette hypothèse, les équipes d’INRAE et de l’Ifremer ont élevé des bars à basse température (16°C) pendant des périodes allant de 11 à 244 jours à partir de la fécondation, avant de les transférer à une température plus clémente de 21°C. Les chercheurs ont ainsi d'abord confirmé l'hypothèse généralement admise qu'une température basse (<17°C) dans les 56 premiers jours de vie oriente préférentiellement les jeunes bars vers le sexe femelle. Par contre, au-delà de 56 jours, le maintien d’une basse température a eu un effet inverse, orientant les animaux vers le sexe mâle, pour atteindre jusqu'à plus de 90% de mâles après 230 jours à 16°C.
Il s'agit de la première observation d'effets opposés de la température sur le déterminisme du sexe à différents stades du développement, montrant une complexité inédite des effets de la température sur ce déterminisme. Ces résultats ouvrent des perspectives nouvelles de compréhension de l'évolution des systèmes de déterminisme du sexe, des effets du changement climatique sur les populations naturelles et de maîtrise des pratiques d’élevage aquacole.
L’Animalerie Aquatique de l’Institut IGBMC
L’animalerie aquatique de l’institut IGBMC est une ressource partagée qui offre des services d'aquaculture à un groupe diversifié de chercheurs utilisant le poisson zèbre comme organisme modèle. Le poisson zèbre présente plusieurs avantages, notamment des embryons optiquement transparents, une facilité de manipulation génétique, un génome séquencé, un développement externe rapide, une fécondité élevée et des exigences d'élevage simples. Ces avantages offrent des opportunités de recherche pour explorer les mécanismes moléculaires afin d'améliorer notre compréhension du développement humain et des maladies.
L’animalerie aquatique a une capacité de plus de 1 200 aquariums avec un personnel dédié à temps plein pour s'occuper de plusieurs milliers de poissons. Le personnel nourrit environ 3,5 millions d'artémias par jour et plus de 50 kilogrammes de nourriture pour poissons par an. C'est beaucoup pour un poisson de seulement 4 centimètres ! Les installations utilisent de grands systèmes d'aquaculture en recirculation pour abriter les poissons et assurer une santé optimale.
L'installation aquatique dispose de salles d'intervention dédiées équipées d'incubateurs, de micro-injecteurs et d'une étireuse de capillaires. L'installation aquatique comprend une salle de quarantaine isolée pour les poissons importés et malades. Cette ressource partagée est disponible pour tous les chercheurs de l'IGBMC et aux utilisateurs externes et est utilisée actuellement par quatre laboratoires de recherche de plusieurs départements de l’institut. Sous la direction de la responsable technique, Sandrine Geschier et de la responsable scientifique et opérationnelle de l’animalerie, le Dr Christelle Golzio, l’animalerie bénéficie d'un agrément délivré par la direction départementale de la cohésion sociale et de la protection des populations (DDSCPP).
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