Introduction
La génétique joue un rôle de plus en plus important en pédiatrie, influençant le diagnostic, le pronostic et le traitement de nombreuses maladies. En France, plusieurs initiatives et structures se sont développées pour intégrer les avancées de la génomique dans les soins aux enfants, allant de la prévention de la mort subite du nourrisson à l'amélioration du diagnostic des cancers pédiatriques et des maladies rares. Cet article explore les différentes facettes de l'association génétique en pédiatrie en France, en mettant en lumière des exemples concrets de programmes de recherche, de réseaux de centres experts et d'associations de patients qui contribuent à faire progresser ce domaine.
Prévention de la Mort Subite du Nourrisson : L'apport de la Génétique
La mort subite du nourrisson (MSN) est une tragédie qui touche encore de nombreuses familles. Face à ce défi, le Centre de prise en charge de la mort subite du sujet jeune a étendu son action aux nourrissons, grâce au soutien de l'association SA VIE. L'objectif principal de ce centre est d'identifier les causes cardiaques sous-jacentes à la MSN et de mettre en place un dépistage familial pour prévenir d'autres décès dans la même famille.
Un Programme de Recherche Prometteur
Un programme de recherche spécifique vise à évaluer la fréquence des maladies héréditaires du rythme cardiaque chez les nourrissons décédés de MSN inexpliquées. Ce programme, qui analyse 162 gènes, représente un espoir significatif dans la compréhension et la prévention de ces décès. L'association SA VIE joue un rôle crucial en contribuant au financement de ces recherches, dont le budget estimé sur 3 ans est de 170 000 euros.
Extension du Programme à l'échelle Nationale
Sous l'impulsion du Pr Probst et du Dr Vrignaud, le centre de prévention de la mort subite des jeunes adultes a été étendu aux nourrissons. En janvier 2013, ce programme a été étendu à tous les enfants décédés de mort inattendue du grand ouest de la France (Poitiers, Angers, Nantes Tours, Brest, Rennes, Le Mans, La Roche sur Yon…), en attendant une généralisation sur le territoire national.
Le Plan France Médecine Génomique 2025 et les Maladies Rares
Le Plan France Médecine Génomique 2025 (PFMG2025) représente une initiative majeure pour intégrer la génomique dans le système de santé français. L'un des objectifs clés de ce plan est d'améliorer le diagnostic et la prise en charge des maladies rares, dont beaucoup se manifestent dès l'enfance.
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La Filière FAI²R et le Séquençage du Génome Entier
La filière FAI²R (Filière de Santé Maladies Rares Immuno-Hématologiques et Inflammatoires) est un exemple de réseau d'experts qui s'engage activement dans l'application de la génomique aux maladies rares. En 2019, FAI²R a été sélectionnée dans le cadre d'un appel à projets pour les pré-indications d'analyse génétique du PFMG2025.
Pour les patients présentant des éléments en faveur d’une maladie auto-immune ou auto-inflammatoire monogénique, discutés lors des RCP nationales FAI²R (ou celles des centres de référence CeRéMAIA ou RAISE) et pour lesquels les analyses génétiques proposées ne sont pas contributives, un séquençage de l’ensemble du génome (Whole Genome Sequencing, WGS) avec analyse en trio de préférence (patient + ses 2 parents) peut être proposé. La RCP génomique FAI²R a validé l’indication au Whole Genome Sequencing (WGS) pour le patient que vous avez présenté. Vous allez pouvoir réaliser une e-prescription sur la plateforme de séquençage SeqOIA ou AURAGEN, pour cela vous allez devoir passer par l’outil de prescription et d’orchestration de la plateforme de séquençage concernée.
La Médecine Personnalisée au Service des Maladies Rares
La médecine personnalisée, basée sur l'analyse du génome de chaque individu, est au cœur de l'innovation en matière de diagnostic, de pronostic et de traitement des maladies rares. Elle permettra à terme d’améliorer le diagnostic des quelques 7 000 maladies rares recensées à ce jour et d’éviter « l’errance diagnostique » de patients qui passent souvent d’établissement en établissement avant d’être dépistés. Cette médecine personnalisée passe par l’analyse de la nature et l’ordre d’enchaînement des gènes qui composent l’ADN de chaque personne pour déterminer les risques de développer certaines maladies, pour adapter les traitements en fonction du patient et pour anticiper ses réactions face aux médicaments administrés.
PREDCAP : Améliorer la Compréhension des Prédispositions Génétiques aux Cancers Pédiatriques
Les cancers de l'enfant et de l'adolescent sont des maladies rares, mais environ 7 à 10 % des cas sont associés à une anomalie génétique prédisposante. Pour mieux comprendre ces prédispositions et améliorer le conseil génétique aux familles, l'observatoire national PREDCAP a été créé.
Un Observatoire National des Prédispositions Génétiques
PREDCAP (Prédispositions aux Cancers Pédiatriques) est un observatoire national français qui agrège les informations cliniques et génétiques générées par les centres d'oncologie en France. Réunissant plus de 20 centres et laboratoires d’oncogénétique français, PREDCAP agrégera dans un premier temps l’ensemble des informations de façon rétrospective d’environ 500 enfants atteints d’un cancer dont la cause génétique a été identifiée au cours des 15 dernières années. Tous les centres SFCE et les services de génétique pourront alimenter la base PREDCAP en données à partir des patients déjà ou nouvellement identifiés comme porteur d’une anomalie génétique prédisposante.
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Objectifs de PREDCAP
Améliorer les connaissances sur les risques de survenue de tumeur dans le cadre des syndromes de prédisposition aux cancers de l’enfant et de l’adolescent déjà connus ou nouvellement identifiés est indispensable pour mieux guider le conseil génétique familial et la surveillance des patients porteurs. C’est l’objectif fixé par PREDCAP. Le Plan France Médecine Génomique 2025, qui prévoit le séquençage en routine du génome complet tumoral et constitutionnel pour une prise en charge diagnostique et personnalisée des cancers pédiatriques, permettra d’identifier un nombre plus important d’enfant ou d’adolescent atteint de cancer et/ou porteur d’une prédisposition génétique avérée ou probable.
Accès aux Données et Gouvernance de PREDCAP
Toute équipe de recherche proposant un projet pourra accéder à la base ou à ses données après validation du comité de pilotage. PREDCAP est gérée par un comité de pilotage de 9 membres : oncologues, pédiatres, onco-généticiens, épidémiologistes et biologistes, dont les membres sont issus des 3 centres coordonnant le consortium, des responsables des cohortes déjà existantes et des membres désignés par des instances autonomes, telles que la SFCE et le Groupe Génétique et Cancer. La base est hébergée sur un serveur français de données de santé agréé et sécurisé avec des droits d’accès validés par son comité de pilotage. Le degré d’identification des données est régi par le profil utilisateur, entre le soin et pseudonymisé pour la recherche.
Les Centres de Référence pour les Anomalies du Développement
Les anomalies du développement et les syndromes malformatifs représentent un ensemble complexe de pathologies qui nécessitent une expertise multidisciplinaire. En France, le réseau national des centres de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs (CLAD) joue un rôle essentiel dans le diagnostic, le suivi et la prise en charge de ces affections.
Le Centre de Référence Coordonnateur CLAD IDF
Le centre de référence coordonnateur CLAD IDF de l’hôpital Robert Debré, regroupe l’ensemble des professionnels de santé experts impliqués dans le diagnostic, le suivi, la prise en charge, la recherche et la formation. Il réunit les services et consultations de génétique des hôpitaux : Robert-Debré, Necker, La Pitié-Salpêtrière, Trousseau, Henri Mondor, et les CHI de Créteil et Poissy-St Germain. Le centre de référence coordonnateur pour les Anomalies du Développement et syndromes malformatifs CLAD Ile de France a été créé lors du premier appel d’Offre en 2004 par le Pr Alain Verloes Chef du Département de Génétique de Robert Debré. Également Coordonnateur européen du réseau de référence pour les maladies rares ERN ITHACA, depuis 2018 qui compte 71 CHU répartis dans 26 pays d’Europe.
Missions du Centre CLAD IDF
En 2017, sur proposition de la filière AnDDI-Rare le centre de référence coordonnateur s’est vu attribué la mission supplémentaire d’animer un réseau à orientation chirurgicale et de médecine ré-adaptative dédiée aux malformations des membres (CEREFAM pour Centre de Référence des Anomalies des Membres). En 2022, La re labellisation du Centre coordonnateur CLAD AnDDI-Rares - Île de France, conforte cette structuration de ses deux axes thématiques : un axe généraliste couvrant tous types d’anomalies du développement embryonnaire « axe Génétique » et un axe spécifique consacré aux malformations des membres «axe CEREFAM ». Par ailleurs depuis cette dernière re labellisation de 2022, le Centre de référence coordonnateur CLAD IDF est désormais coordonné par le Dr Yline CAPRI, Praticien Hospitalier au sein du département de Génétique Robert Debré. Il dispose du soutien partenarial d’un fort réseau d’Associations.
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Expertise et Technologies Avancées
Ce centre traite une grande variété de cas : il identifie plus de 5500 syndromes et anomalies congénitales multiples, y compris plus de 3000 maladies monogéniques et toutes les anomalies chromosomiques, principalement identifiées par des technologies avancées. Il prend en charge les troubles dysmorphologiques multifactoriels et sporadiques ainsi que des embryofœtopathies d’origine environnementale. Il gère plus de 1500 formes monogéniques de DI, avec ou sans troubles du spectre autistique associés. Notre CRMR rassemble des experts médicaux et des représentants d’Associations de patients. Il vise à améliorer, grâce notamment à un accès aux plateformes de génomique, le diagnostic précoce, les soins et la guérison des patients atteints de SDP ou de malformations des membres, à conseiller et accompagner leurs familles, à fournir un soutien à la recherche clinique, et à élaborer des PNDS. Ils assurent l’évaluation diagnostique des patients atteints de pathologies génétiques ou susceptibles de l’être, dans diverses circonstances (grossesse, enfant, adultes). Ils prescrivent les bilans génétiques à visée étiologieque. Elle assure des consultations d’information et de conseil génétique (antécédent familial de pathologie génétique dans le cadre d’une enquête familiale), ou de diagnostic anténatal. Le centre de l’hôpital Robert-Debré est le centre de référence coordonnateur du réseau national des centres de référence des anomalies du développement et syndromes malformatif (CLAD), et des anomalies des membres (CEREFAM).
Rôle des Associations de Patients
Les associations de patients jouent un rôle crucial dans le domaine de la génétique en pédiatrie. Elles apportent un soutien aux familles touchées par des maladies génétiques, sensibilisent le public et les professionnels de santé, et contribuent au financement de la recherche. L'association SA VIE, mentionnée précédemment, est un exemple de l'impact positif que peuvent avoir ces organisations.
L'Expertise des Pédiatres et des Spécialistes
La prise en charge des maladies génétiques en pédiatrie repose sur l'expertise de nombreux professionnels de santé, notamment les pédiatres, les généticiens, les cardiologues, les pneumologues, les endocrinologues et les spécialistes de la santé publique. Leur collaboration est essentielle pour assurer un diagnostic précis, un suivi adapté et une prise en charge globale des enfants atteints de maladies génétiques.
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