Découvrez Tout sur l'Examen Cytobactériologique des Urines en Pédiatrie : Fiche Technique Essentielle à Ne Pas Manquer !

L'examen cytobactériologique des urines (ECBU) est un outil diagnostique essentiel en pédiatrie pour la détection des infections urinaires. Cet article détaille la technique, l'interprétation et l'importance de l'ECBU dans le contexte pédiatrique.

Introduction

Les infections urinaires communautaires sont fréquentes chez l'enfant, représentant la deuxième cause d'infection bactérienne après les atteintes respiratoires. Elles se manifestent sous diverses formes cliniques, allant de la cystite aiguë à la pyélonéphrite aiguë (PNA), avec des degrés de gravité variables. L'ECBU est l'examen de référence pour confirmer une infection urinaire, bien qu'il ne soit pas toujours réalisé en première intention. La bandelette urinaire (BU) est souvent utilisée comme test de dépistage rapide.

Qu'est-ce que l'ECBU ?

L’ECBU ou « examen cytobactériologique des urines » est un examen microscopique des urines parmi les différents examens de biologie médicale. Il est réalisé sur prescription médicale. Contrairement à la BU, qui est un test qualitatif d'orientation, l'ECBU quantifie précisément les leucocytes et les bactéries, identifie le germe responsable et détermine sa sensibilité aux antibiotiques. Le laboratoire peut transmettre les premiers résultats en quelques heures.

Objectifs de l'ECBU

L'ECBU est couramment utilisée pour :

Diagnostiquer une infection urinaire.
Détecter une maladie inflammatoire de la vessie (cystite interstitielle).
Identifier une bactériurie asymptomatique.
Rechercher une hématurie microscopique.

Il est important de noter que l’ECBU n’identifie pas le cancer et ne peut pas non plus exclure complètement le cancer. La cytologie des urines (cytologie urinaire) consiste à rechercher au microscope des cellules anormales afin de détecter des cancers des voies urinaires (vessie, rein, uretères et urètre). La cytologie urinaire est une procédure différente d'une biopsie : elle examine des cellules individuelles, plutôt que des morceaux de tissu contenant de nombreux groupes de cellules. Les cellules pour la cytologie urinaire sont plus faciles à obtenir que les tissus, causant moins d'inconfort et moins de risques pour le patient.

Indications de l'ECBU en Pédiatrie

L'ECBU est indiqué dans les situations suivantes :

Fièvre inexpliquée: Toute fièvre inexpliquée chez le nourrisson doit faire suspecter une infection urinaire. En cas de fièvre sans point d’appel évident ou survenant chez un enfant ayant une uropathie malformative, il faut réaliser une BU ± ECBU (avant l’âge de 1 mois, l’ECBU doit être systématique).
Suspicion d'infection urinaire: En cas de résultat positif à la bandelette urinaire (BU) pour les leucocytes et/ou les nitrites, un ECBU est nécessaire pour confirmation.
Infections urinaires récidivantes: Pour les premiers épisodes de récidive, la réalisation d’un ECBU est indiquée. En cas de récidives rapprochées, une antibioprophylaxie peut être envisagée lorsque la fréquence atteint au moins un épisode par mois.
Situations à risque: La grossesse constitue une situation à risque d’infection urinaire. La bactériurie asymptomatique pendant la grossesse doit être traitée afin de réduire le risque de pyélonéphrite et de complications obstétricales.
Uropathie malformative connue: Chez les enfants présentant une uropathie malformative, une surveillance régulière par ECBU peut être nécessaire.

Prélèvement d'Urine : Technique et Recommandations

La qualité du recueil des urines est primordiale pour garantir la fiabilité des résultats de l'ECBU. Un prélèvement contaminé peut conduire à un diagnostic erroné et à un traitement inapproprié.

Préparation au Prélèvement

Moment du prélèvement: Réaliser le prélèvement le matin au réveil ou au moins 4 heures après la dernière miction pour obtenir des urines plus concentrées.
Toilette intime: Effectuer une toilette intime minutieuse avant le recueil.
Type de jet: Recueillir le second jet d’urine, en laissant couler le premier jet dans les toilettes ou le dispositif de recueil, puis prélever le jet médian sans contact entre le flacon et la peau.
Matériel: Utiliser un flacon stérile et un tube boraté. Remplir le tube boraté jusqu’au trait indiqué pour maintenir la concentration d’acide borique.
Homogénéisation: Homogénéiser le prélèvement en retournant délicatement le tube plusieurs fois.
Conservation: Refermer immédiatement le flacon après le recueil pour préserver la stérilité de l’échantillon. La conservation de l’ECBU dépend du dispositif utilisé.

Méthodes de Recueil Chez l'Enfant

Le recueil d’urines chez l’enfant doit respecter des règles strictes afin de limiter les contaminations. Plusieurs méthodes peuvent être utilisées :

Poche: Pour le nourrisson, on installe une poche stérile directement dans la couche. Le prélèvement s’effectue de préférence le matin au réveil pour laisser un écart de 4h par rapport à la miction précédente. Cela laisse le temps à l’urine de séjourner suffisamment longtemps dans la vessie. En cas d’infection urinaire avérée, les bactéries auront migré en quantité suffisante pour permettre une analyse efficace. En cas d’impossibilité, le recueil peut aussi se faire plus tard dans la journée.
- Préparer son nourrisson au prélèvement : On procède d’abord par une toilette, puis on désinfecte les parties génitales avec une lingette antiseptique. Ces premières étapes sont importantes pour éliminer les éventuelles traces de crème ou de poudre.Avant toute chose, lavez-vous les mains à l’eau et au savon.Ensuite, positionnez votre enfant sur le dos pour réaliser sa toilette.Après avoir retiré sa couche, nettoyez la zone urogénitale avec de l’eau et du savon.Chez une fille, chaque geste doit être effectué de l’avant vers l’arrière, du pubis vers les fesses. Pour bien nettoyer son méat urinaire, pensez à écarter les grandes et les petites lèvres du sexe. Chez un garçon, nettoyez le pénis : le prépuce, le gland et également le méat urinaire. (Le méat urinaire est le nom donné à l’orifice par lequel le bébé fait pipi, situé juste au-dessus de l’orifice vaginal chez la fille et au bout du pénis pour le garçon).Une fois nettoyée, la peau doit être parfaitement séchée avec un linge totalement propre (pas utilisé avant).Finissez ensuite de désinfecter à l’aide de la lingette antiseptique fournie dans le kit.Retirez délicatement la poche de son emballage et manipulez-la avec précaution. Il faut faire très attention à ne pas toucher l’intérieur de la poche avec vos doigts, afin de ne pas la contaminer.Placez-la de façon que la partie évidée (ouverte) recouvre toute la zone urogénitale de la petite fille ou de façon que le pénis du petit garçon soit à l’intérieur de cette partie. Le but est de bien recouvrir le méat urinaire (par où le bébé fait pipi).Pour éviter toute fuite, massez délicatement la partie adhésive de la poche pour qu’elle colle bien à la peau.Une fois la poche posée, restez attentif à son remplissage. Il est préférable de garder bébé sans couche ou couche ouverte sur vos genoux : il n’est pas obligé de rester allongé, vous pouvez le maintenir assis ou debout.Le délai de pose de la poche est de 30 minutes. Donner à boire régulièrement au bébé avant de poser le collecteur d’urines. Une grande quantité d’eau permettra également la migration d’un plus grand nombre de germes (bactéries) dans les urines. Sachez qu’un bébé fait pipi environ toutes les 20 à 30 minutes. Si au bout de 20 minutes votre enfant n’a pas uriné, recommencez les étapes précédentes.Important : S’il y a eu un accident au moment de la pose ou si la poche est souillée ou décollée, même légèrement, il est recommandé de recommencer les étapes depuis la désinfection pour éviter de fausser les résultats ou de répandre la contamination. Ne vous inquiétez pas, le laboratoire vous fournira plusieurs kits, au cas où.Quand la poche est remplie, décollez-la doucement et mettez-la entièrement à l’intérieur du pot stérile, sans transvaser les urines ! Ce dernier détail est très important pour limiter les risques de renverser les urines et de propager malencontreusement les bactéries qui pourraient s’y trouver. Refermez bien le pot et collez l’étiquette dessus. Remplissez la fiche de renseignement que vous remettrez au laboratoire avec le pot.Le pot se conserve à température ambiante. Nous vous recommandons de déposer le prélèvement au laboratoire, de préférence dans les 2 heures après la collecte. Si ce n’est pas possible, il peut rester au réfrigérateur pendant dix heures. Le mieux reste quand même de le déposer le plus rapidement possible au laboratoire.
Recueil per-mictionnel (milieu de jet): Pour un enfant qui fait déjà pipi dans le pot, le prélèvement d’urines peut se faire directement à l’aide d’un flacon stérile de recueil comme celui qu’utilisent les adultes.Lavez-vous les mains puis désinfectez les parties génitales de l’enfant à l’aide d’une lingette.Ensuite, il faut placer le pot sous le jet d’urine en faisant bien attention à ne pas toucher l’intérieur du flacon avec les doigts. Sinon, les germes présents naturellement sur les doigts peuvent être confondus avec ceux potentiellement présents dans l’urine. L’analyse risquerait ainsi d’être faussée. Lavez-vous les mains après avoir refermé le flacon.

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Sondage urinaire ou ponction sus-pubienne: Dans certaines situations, le recueil d’urine stérile peut être difficile, notamment chez les patients incontinents. → Chez la femme, un sondage évacuateur peut être réalisé uniquement après avis médical.

Dans certains cas, des techniques simples de stimulation (tapotements sus-pubiens, massages lombaires) sont utilisées pour favoriser un recueil en milieu de jet chez les nourrissons.

Transport de l'Échantillon

Le pot se conserve à température ambiante. Il est recommandé de déposer le prélèvement au laboratoire, de préférence dans les 2 heures après la collecte. Si ce n’est pas possible, il peut rester au réfrigérateur pendant dix heures. Le mieux reste quand même de le déposer le plus rapidement possible au laboratoire.

Analyse et Interprétation des Résultats

Interpréter les résultats nécessite une analyse méthodique combinant les données cytologiques, bactériologiques et le contexte clinique du patient.

Analyse Macroscopique

L’analyse macroscopique constitue la première étape et repose sur l’observation directe des urines, avant toute manipulation technique. L’urine normale est jaune pâle à ambrée, limpide et d’odeur discrète.

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Analyse Cytologique

Cette technique analyse la composition cellulaire des urines.

Cellules épithéliales: Les cellules épithéliales sont des cellules de revêtement qui tapissent l’ensemble des voies urinaires. Leur présence dans les urines est physiologique en faible quantité, car elles se renouvellent naturellement. En revanche, une augmentation de leur nombre traduit souvent une irritation mécanique (comme le passage d’un calcul) ou une inflammation liée à une infection urinaire.
Leucocytes (globules blancs): Le taux physiologique de leucocytes (globules blancs) dans les urines est < 10⁴/mL (soit < 10 000/mL). Les leucocytes migrent dans l’urine pour défendre l’organisme. Cas particuliers : → Une leucocyturie sans bactériurie peut également être observée. La leucocyturie est significative si ≥ 104/ml.

Analyse Bactériologique

Il permet d’identifier et de quantifier les bactéries présentes dans l’échantillon urinaire. La bactériurie correspond à la concentration de bactéries dans les urines, exprimée en unités formant colonies (UFC) par millilitre.

Germes impliqués: Les entérobactéries sont les principales bactéries impliquées dans les infections urinaires communautaires avec parmi elles l’Escherichia coli (E. coli). Autres entérobactéries (entérocoques, S.
Antibiogramme: Lorsqu’un germe pathogène est identifié, le laboratoire réalise un antibiogramme pour tester la sensibilité de la souche bactérienne par rapport à différents antibiotiques.

Interprétation des résultats

ECBU polymicrobien: La présence de plusieurs bactéries sans germe dominant définit un ECBU polymicrobien. Cela traduit le plus souvent une contamination du prélèvement liée à un manque d’hygiène ou un recueil mal effectué.
Leucocyturie sans bactériurie: Une leucocyturie sans bactériurie doit faire évoquer une infection urinaire décapitée par un traitement antibiotique, une vulvite, ou encore une maladie inflammatoire (par exemple, maladie de Kawasaki).
Bactériurie sans leucocyturie: Une bactériurie sans leucocyturie doit faire évoquer une souillure ou une infection urinaire débutante.

Le résultat de l’ECBU doit être interprété en tenant compte de la qualité du prélèvement urinaire et du contexte clinique.

Conduite à Tenir en Cas d'Infection Urinaire

En cas d’infection urinaire chez un nourrisson, il est important de réagir rapidement car elle peut très vite migrer dans les reins, et y provoquer une infection (pyélonéphrite). Plus le diagnostic est posé tôt, meilleure est la prise en charge. Au laboratoire, l’analyse passe d’ailleurs en priorité pour avoir les résultats rapidement et prévoir un traitement adapté. Votre médecin traitant reçoit directement le compte rendu de résultats de l’ECBU. Si l’infection urinaire est confirmée, il prescrira alors un traitement antibiotique.

Traitement

L’antibiothérapie a pour but d’éviter la dissémination bactérienne et de limiter le risque de cicatrices rénales. Il convient de recourir à des antibiotiques ayant une bonne concentration dans le sang et le parenchyme rénal, ainsi qu’une bonne élimination urinaire. L’antibiothérapie est débutée dès que possible, idéalement après les résultats de l’examen direct des urines s’il est possible et rapide. Elle est probabiliste dans sa phase initiale, avant les résultats de la culture et de l’antibiogramme, et tient compte des profils de sensibilité habituels des principaux germes responsables d’infections urinaires en milieu communautaire (E. coli).

Antibiothérapie initiale orale d’emblée: seul le céfixime est indiqué, mais uniquement à partir de 3 mois et en l’absence de critère de gravité.
Choix d'un traitement par aminoside IV: permet de limiter l’usage des céphalosporines, principales molécules responsables de la sélection et de la diffusion des entérobactéries BLSE.

Surveillance

La stratégie antibiotique permet habituellement d’obtenir l’apyrexie et la stérilisation des urines en moins de 48 heures. La surveillance est avant tout clinique.

Examens Complémentaires

En cas de PNA (systématique pour un premier épisode), l’échographie de l’appareil urinaire reste recommandée actuellement en première intention dans les premiers jours de prise en charge. La cystographie rétrograde est l’examen qui permet d’objectiver un RVU (reflux vésico-urétéral). Cet examen est indiqué lors qu’existent des anomalies échographiques nécessitant d’être précisées ou en cas d’épisodes répétés de PNA (sauf contexte typique d’instabilité vésicale). D’autres paramètres sont susceptibles de moduler son indication : jeune âge, sexe et germe.

Prophylaxie

Aucun consensus n’existe à l’heure actuelle et il n’y a que peu d’arguments dans la littérature démontrant son intérêt pour la prévention des cicatrices rénales à long terme. Si elle est instaurée, l’antibioprophylaxie (cotrimoxazole après l’âge de 1 mois, en prise unique le soir) se heurte au risque de non-observance, de modification de la flore bactérienne et au caractère empirique de sa prescription. Les médicaments à base de nitrofurantoïne sont désormais contre-indiqués chez l’enfant en prophylaxie du fait des risques d’effets secondaires, pulmonaires notamment. S’ils sont utilisés, l’indication doit être posée par un spécialiste, et ce pour la durée la plus courte possible.

Rôle de l'Infirmier(e)

L’infirmier(e) joue un rôle clé dans la réalisation du prélèvement urinaire et la prévention des infections urinaires. Au-delà du simple examen biologique, l’ECBU s’intègre dans une démarche clinique et préventive. Pour l’infirmier(e), sa réalisation constitue un acte de soin à part entière qui mobilise ses compétences techniques, relationnelles et éducatives. Enfin, la prévention reste un axe majeur du rôle infirmier : informer, hydrater, encourager de bonnes pratiques d’hygiène et de miction.

Conclusion

L'ECBU est un examen essentiel pour le diagnostic et le suivi des infections urinaires en pédiatrie. Une technique de prélèvement rigoureuse, une interprétation méthodique des résultats et une prise en charge rapide sont indispensables pour prévenir les complications et assurer une guérison complète de l'enfant.

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Examen Cytobactériologique des Urines (ECBU) en Pédiatrie : Fiche Technique